Het algemeen bestuur is het hoogste beslisorgaan van het waterschap. Het algemeen bestuur bestaat uit 30 leden, waarvan 26 verkiesbare en 4 geborgde (niet verkiesbare) zetels.

Het dagelijks bestuur bestaat uit de dijkgraaf, secretaris-directeur en vier hoogheemraden. De dijkgraaf wordt voor zes jaar benoemd door de Kroon. De hoogheemraden worden voor een periode van vier jaar gekozen uit en door het algemeen bestuur.

Het college van dijkgraaf en hoogheemraden is verantwoordelijk voor de beleidsvoorbereiding en het uitvoeren van besluiten van het algemeen bestuur. Elk collegelid heeft een eigen portefeuille met onderwerpen. Daarnaast hebben de hoogheemraden ieder een geografisch aandachtsgebied.

Het dagelijks bestuur vergadert iedere week op dinsdag. Deze vergaderingen zijn niet openbaar.

In commissies uit het algemeen bestuur (AB) worden de voorstellen van het college voorbesproken en wordt hierover advies uitgebracht aan het college, waarna de voorstellen ter besluitvorming aan het AB worden voorgelegd.
Elke fractie heeft de mogelijkheid om een duocommissielid aan een commissie te laten deelnemen. Een geïnstalleerd duocommissielid is niet tevens AB-lid, maar stond wel op de kandidatenlijst voor de verkiezingen c.q. op de reservelijst voor de geborgde AB-zetels.